BreSci - Divulgada a Programação

Quinta-feira: 25/07

08:30-08:45 – Abertura

 

08:50-10:30 – Sessão Técnica 1: Workflows científicos

DynAdapt: Alterações na Definição de Atividades de Workflows Científicos em Tempo de Execução
Igor Santos, Jonas Dias, Daniel de Oliveira, Eduardo Ogasawara, Marta Mattoso

RFlow: Uma Abordagem de Reutilização de Workflows Estatísticos Legados
José Antônio Pires do Nascimento, Sergio Manuel Serra da Cruz

Expressando Atributos Não-Funcionais em Workflows Científicos
Vívian Medeiros, Antônio Tadeu Azevedo Gomes

Uma Arquitetura P2P de Distribuição de Atividades para Execução Paralela de Workflows Científicos
Vítor Sousa, Jonas Dias, Daniel de Oliveira, Eduardo Ogasawara, Marta Mattoso

 

11:00-11:10 – Sessão de Pôsteres 1

Uma Abordagem de Gerenciamento Semântico de Experimentos Meteorológicos em Pluviometria
Thiago Barbosa, Sergio Manuel Serra da Cruz

Um Módulo de Sensoriamento Voluntário para um Sistema de Monitoramento de Desmatamento
Felipe Correa, Eduardo Luz, Fernando Ramos

 

11:10-12:00 – Sessão Técnica 2: Sistemas colaborativos

A case of Citizen Science for Cell Biology Images Analysis
Eduardo Lostal, Fermín Serrano, Carlos Val, Francisco Sanz, José Carrodeguas, Patricia Martínez

Providing volunteer computing at the infrastructure level to support e-science applications
Felipe Gutierrez, Marcos Barreto, Antônio Tadeu Azevedo Gomes

 

12:00-13:00 – Palestra: Cloud Computing for Science: the e-Science Central Experience (Paul Watson, Newcastle University)

Cloud Computing has the potential to revolutionise e-science. However, to achieve this a number of major challenges must be overcome. For the past 5 years we have been exploring solutions through the design, development and deployment of an open source cloud platform called “e-Science Central”. This allows users to collaborate in the storage and analysis of data on the cloud. In this talk we will describe the design of the platform and discuss how it has been used in a wide range of science applications including X-ray spectroscopy, activity analysis to improve the health of older people, and cancer research. Key features that will be described include scalability, security and reproducibility.

 

17:00-17:15 – Sessão de Pôsteres 2

NanoTrack - Sistema de Gerenciamento de Dados de Nanoestruturas com Plugins Inteligentes
André Silva, Paulo Batista, Artur Costa, Alessandra Faria-Campos, Sergio Campos, Omar Vilela Neto

Ciberinfraestrutura para integração, acesso, compartilhamento e reuso de dados de pesquisa da área nuclear
Luana Sales, Luís Fernando Sayão

Análise de Instantes de Trânsitos em Exoplanetas Usando o Programa TAP
Marildo Geraldête Pereira, Leonardo A. Almeida, Aysses do Carmo Oliveira

 

17:20-18:00 – Sessão Técnica 3: Astronomia 1

DECam Master calibration pipeline
Ricardo Ogando, Angelo Fausti Neto, Luiz da Costa, Patricia Egeland, Marcio Maia, Eduardo del Peloso, Cristiano Singulani, Valter Machado

Algoritmos de Cross-Matching de Dados Astronômicos
Vinícius Freire, Fabio Andre Porto, Ana Maria de Carvalho Moura, José Antonio Macêdo

 

18:00-19:00 - Palestra: Extreme Scale Data - LSST, XLDB and Beyond (Jacek Becla, SLAC National Accelerator Laboratory)

Managing and analyzing extreme scale data sets are a major challenge for many scientific and industrial projects. The talk will describe the complexity and the reality of petascale analytics, drawing from the work on Large Synoptic Survey Telescope (LSST) and Extremely Large Databases (XLDB). It will provide a broad overview of the LSST Data Management system, technical details of the scalable LSST database implementation, and a summary of the lessons learned from the XLDB events and activities.

 

Sexta-feira: 26/07

08:30-08:40 – Sessão de Pôsteres 3

Uma proposta de adaptação do algoritmo Branch-and-Prune usando a interseção de quatro esferas para o Problema de Geometria de Distâncias Moleculares
Clarice de Souza Santos, Rosiane de Freitas

Bioinformatic Resources for Genomic Information Retrieval on Distributed Computing Approach
Wagner Arbex, Leonardo Costa, Leonardo Fonseca, Camillo de Léllis Silva

 

08:40-09:30 – Sessão Técnica 4: Proveniência de Dados

Uma Comparação entre os Modelos de Proveniência OPM e PROV
Bárbara Bivar, Lucas Santos, Troy Kohwalter, Vanessa Braganholo, Anderson Marinho, Marta Mattoso

Assimilação, Controle de Qualidade e Análise de Dados de Meteorológicos Apoiados por Proveniência
Geraldo R. L. Filho, Raíza S. Precinoto, Tamíres P. Correia, Ednaldo O. Santos, Gustavo Lyra, Sergio Manuel Serra da Cruz

 

09:30-10:30 – Palestra: High-Throughput Transcriptomics -- Every Byte Counts! (Michael Sammeth, LNCC)

With the advent of high-throughput sequencing technologies, the time of naive programming has finally passed. In my seminar I will outline general needs and chalenges in computational biology in analyzing large-scale transcriptome sequencing (RNA-seq) experiments. Particularly, I will introduce splicing graphs as a non-redundant form of storing transcriptome information, upon which we developed efficient techniques to solve various problems of RNA-seq.

 

11:00-12:00 – Sessão Técnica 5: Astronomia 2

CYCLOPS-Web: Um portal de simulações da emissão de estrelas do tipo polares
Danielle Emygdio, Cláudia Rodrigues, Waléria Antunes, Joaquim Costa, Valdivino Santiago Júnior, Karleyne Silva

An automatic procedure for photometry and astrometry in crowded fields
Leonardo A. Almeida

End-to-end scientific processing in the LIneA Science Portal.
Luiz da Costa, Angelo Fausti Neto, Ricardo Ogando, Patricia Egeland, Marcio Maia, Eduardo del Peloso, Carlos Adean de Souza, Valter Machado

 

12:00-12:50 – Sessão Técnica 6: Bioinformática 1

Mineração de Regras de Classificação de Câncer utilizando Nondominated Sorting Genetic Algorithm II (NSGA-II)
Vitor Coelho, Claudomiro Souza Junior

Decifrando Cisteíno Proteases em Plasmodium: Uma Estratégia de Genômica Comparativa e Modelagem Estrutural
Kary Ocaña, Marco T. A. Garcia-Zapata

 

17:00-17:40 – Sessão Técnica 7: Bioinformática 2

Reescrita de código e utilização de Paralelismo de Dados para a busca de Small RNAs (sRNAs)
André Gehring, Edison Machado, Sérgio Fujii, Julia Souza, Maria Steffens, Lucas Ferrari de Oliveira

Apoio computacional para análise quantitativa da expressão de genes envolvidos com a barreira de progressão do câncer
Karlise Soares, Ederson Bastiani, Éder Maiquel Simão, José C. M. Mombach, Giovani Rubert Librelotto

 

17:40-18:40 – Palestra: e-Science in Brazil: The SINAPAD perspective (Antonio Tadeu Azevedo Gomes, LNCC e SINAPAD)

In this talk we present the main e-Science initiatives being carried out within the SINAPAD network, a programme from the Brazilian Ministry of Science, Technology and Innovation which aims at offering HPC services to the Brazilian scientific community. We'll begin the talk by presenting the HPC resources available in SINAPAD, its usage profile and current limitations. We will then proceed with the presentation of some e-Science services that are being offered within SINAPAD to cope with some of such limitations and leverage the quality of experience of its users with regard to the usability and performance of the resources being provided by the network. We will then finish the talk by presenting the mid- and long-term actions that are being planned in the SINAPAD network to considerably expand its e-Science capabilities not only for HPC but also for HTC and Big Data scientific applications.

 

18:40-19:00 – Encerramento