Além da infraestrutura de uso comum a todos os alunos e professores do PPGI, o programa possui vários laboratórios temáticos, que estão associados a grupos e projetos de pesquisa de professores e alunos que participam do PPGI. Grande parte destes laboratórios fica no prédio denominado de CEPETEC (Centro de Pesquisa Tecnológica do Instituto de Computação). Por meio destes laboratórios temáticos, todos os professores do PPGI contam com espaços exclusivos para desenvolvimento de suas pesquisas. Seguem abaixo alguns destes laboratórios. 

- Laboratórios do grupo EASY (Centro de Pesquisa em Engenharia e Sistemas):

Este grupo desenvolve pesquisas na área de Engenharia de Software e Engenharia da Computação e está associado aos professores permanentes Márcio Ribeiro, Baldoino Fonseca e Erick Barboza. O EASY conta com dois espaços. O primeiro é o CEPETEC - EASY, que conta com 17 postos de trabalho (17 mesas em "L" equipadas com computadores) distribuídas em aproximadamente 54 metros quadrados. O laboratório também conta com outros equipamentos, como impressora a laser e scanner. O acesso ao laboratório é feito através de leitura biométrica. O segundo espaço fica no BLOCO IC - EASY Engineering, e conta com uma sala com 4 postos de trabalho para pesquisa e mesa de reuniões para os docentes e discentes associados ao EASY. Site do grupo: https://ic.ufal.br/easy/

- Laboratório do grupo OptLab (Optimization Laboratory): 

O OptLab é liderado pelos professores Bruno Nogueira e Rian Pinheiro. O grupo conta com a sala Prédio 12 - OptLab, que possui 10 postos de trabalho com aproximadamente 45 metros quadrados, e é utilizada para pesquisas na área de Pesquisa Operacional. Site do grupo: https://sites.google.com/view/optlab 

- Laboratório do grupo TIPS (Tecnologias Inteligentes, Personalizadas e Sociais):

Sob a liderança do professor Evandro de Barros Costa e com a participação da professora Xu Yang, o grupo TIPS desenvolve pesquisas em tópicos de Inteligência Artificial (IA), incluindo aprendizagem de máquina, representação de conhecimento e raciocínio, processamento de linguagem natural e visão computacional, assim como IA Generativa. O grupo possui o laboratório CEPETEC - TIPS, que conta com 10 postos de trabalho, com computadores novos. 

- Laboratório do grupo BrAIN (Brazilian Artificial Intelligence Networking in Medicine):

Este grupo executa suas atividades no CEPETEC-BrAIN, que possui 4 postos de trabalho. O grupo realiza pesquisas na área de Inteligência Artificial aplicada à medicina. O grupo é liderado pelo professor Aydano Machado. 

- Laboratórios do grupo NEES (Núcleo de Excelência em Tecnologias Sociais):

Este grupo tem foco em pesquisas voltadas para informática na educação. O NEES conta com a participação dos seguintes professores do PPGI: Alan Pedro, Diego Demerval, Ig Bittencourt, Bruno Pimentel, André Magno, Thiago Cordeiro, Thales Vieira, Ranilson Paiva e Rafael Amorim. O NEES possui duas instalações principais. O primeiro espaço é o CEPETEC - NEES, com 54 metros quadrados, 30 estações de trabalho, uma impressora a laser e uma mesa de reunião, sendo ideal para atividades colaborativas e de menor escala. O segundo é o prédio da Rede de Inovação para Educação Híbrida (RIEH), que possui aproximadamente 3.000 metros quadrados de área construída, incluindo um edifício principal de 950 metros quadrados, com capacidade para 250 pessoas, projetado para eventos de grande porte e atividades educacionais inovadoras. Site do grupo: https://www.nees.ufal.br/ 

- Laboratório do grupo iCAD (ARTIFICIAL INTELLIGENCE APPLIED TO COMPUTER-AIDED DIAGNOSIS):

Este grupo executa suas atividades no CEPETEC- Telessaúde e Informática Médica (L@TIM). O grupo tem como missão o desenvolvimento de soluções tecnológicas de auxílio à tomada de decisão na área de medicina de precisão usando técnicas de inteligência artificial e análise de imagens. O L@TIM possui 13 metros quadrados, com 7 postos de trabalho e computadores com GPU disponíveis para o desenvolvimento de pesquisas. Estão associados ao grupo os professores Marcelo Oliveira e Aydano Machado. 

- Laboratórios do grupo EDGE:

O EDGE tornou-se referência nacional na atuação em projetos de pesquisa e desenvolvimento, entregando resultados e impulsionando pessoas e empresas para a inovação. Desde 2020, o Edge é credenciado como uma Unidade Embrapii, o que traz a chancela de suas competências do ponto de vista científico e tecnológico para atuação em projetos de inovação para o setor industrial. O Edge possui 7 laboratórios espalhados na UFAL, somando 200 postos de trabalho. Além da infraestrutura na UFAL, o grupo possui salas no Centro de Inovação do Polo de Tecnologia, totalizando 83 postos de trabalho e 7 cabines acústicas. Participam deste grupo o professor Tiago Vieira e diversos alunos e ex-alunos do PPGI. Site do grupo: https://www.edge.ufal.br/ 

- Laboratórios do grupo Orion:

O Orion associado aos professores André Aquino e Fabiane Queiroz e realiza pesquisas na área de Ciência dos Dados aplicada à Cidades Inteligentes. O Orion conta com dois espaços estratégicos em Maceió: uma sala no Centro de Inovação Polo Tecnológico, com 120 m2, 20 estações de trabalho, salas de convivência e reunião, e o laboratório Prédio 12 - Orion, que possui uma área climatizada de 22 m2. 

- Laboratório do grupo TOCA (Tecnologias em Computação Acessível):

O grupo de pesquisa TOCA é liderado pelo professor Fábio Coutinho e com a participação do professor André Magno. Ele executa suas atividades de pesquisa no laboratório CEPETEC-TOCA. O laboratório possui 11 postos de trabalho, 36,5 metros quadrados e desenvolve pesquisas nas seguintes áreas: tecnologias assistivas e acessibilidade, realidade virtual e aumentada e internet das coisas. 

- Laboratório do grupo Ciber (Sistemas Ciber-físicos):

Este grupo de pesquisa está associado aos professores Leandro Silva, Ícaro Araújo, Maurício Corrêa e Álvaro Sobrinho. O Ciber funciona no CEPETEC-Ciber, que é um laboratório de 36 metros quadrados, com 18 postos de trabalho, utilizado para o desenvolvimento de pesquisas na área de automação e controle, sistemas inteligentes, robótica, cibersegurança, e informática aplicada à saúde.